應仁之亂（1467年至1477年）後，下醍醐因戰亂而變得滿目瘡痍，除了五重塔外，其餘建築皆蕩然無存。
1598年，豐臣秀吉在醍醐寺舉辦「醍醐花見」，並修建了下醍醐內多座建築，當中包括金堂。
金堂（こんどう）是醍醐天皇的於926年下令興建，當時稱為釋迦堂，原本位於紀伊國有田郡湯淺（今和歌山縣有田郡湯淺町），於1598年應豐臣秀吉要求而遷移到此。
金堂曾在鎌倉時代（12世紀至14世紀）進行大翻新，遷移時亦混雜了桃山時代的技術，整體建築包含多個時代的藝術風格。
粗眉仔雖然喜歡古蹟，卻對金堂周圍的櫻花更有興趣。
金堂對出的鐘樓結構簡單，沒有任何特別之處，但一配上粉紅色的櫻花做背景，立即變得不同凡響。
金堂旁邊就是不動堂和護摩道場，可能這裏沒有櫻花樹，遊客甚少。
不動堂（ふどうどう）內供奉著五尊明王像，當中包括不動明王。不動明王（梵語：अचलनाथ）為佛教密宗的護法之一，是五大明王中鎮守中央方位的明王。
不動堂前是護摩道場，這裏會定時舉辦祈福儀式，焚燒柴燈護摩以祈求世界和平。護摩（梵語：होम）意譯為火供，最早來自於婆羅門教的吠陀祭祀，用以供養火神阿耆尼（अग्नि）以為驅魔求福之作法。
真如三昧耶堂（しんにょさまやどう）由朱雀天皇於949 年下令建造，當時名為法華三昧堂，其後於1470年焚燒毀，直到1997年才重建。
真如（梵語：तथाता）為佛教術語，一般被解釋為法的本性，即法的真實本質，而三昧耶在梵語中則可解作諾言或契約。
由真如三昧耶堂再上，會經過日月門（にちげつもん），日月門外型古樸典雅，儼如迷你版的西大門。
